[備忘録]glmmstanとbrmsでwaicの比較

更新日:

glmmstanとbrmsで研究データを解析しています。

waicを比較する方法を調べたので、忘れないうちにメモです。

以下すべて太字がwaicの比較に必要なコードです。

間違っていたり、もっと良いやり方があったら、ぜひご指摘ください。

glmmstanでwaicの比較は、どうしたらよいかわからなかったので、ちょっと調べたら以下のように記述すると出力できました。

looパッケージを呼び出して比較しています。

結果は、以下のようにelpd_waicの差で示されます。

ちなみにglmmstanの並列化は、Pglmmstanと書くだけでOKです。

brmsはパッケージに書いてある通り、以下のように記述するとwaicの比較ができます。

結果は、以下のようにwaicの差で示されます。

ちなみに、library(brms)の直下にある以下のコードは、並列化するために書いています。

その他、参考になる資料は以下です。

brmsパッケージ


-研究

Copyright© 京極真の研究室 , 2018 All Rights Reserved.